Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms