Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms