Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl39Q9JKF7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl39Q9JKF7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl39Q9JKF7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl39Q9JKF7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Mrpl39Q9JKF7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Mrpl39Q9JKF7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Mrpl39Q9JKF7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Mrpl39Q9JKF7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Mrpl39Q9JKF7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Mrpl39Q9JKF7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Mrpl39Q9JKF7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Mrpl39Q9JKF7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Mrpl39Q9JKF7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Mrpl39Q9JKF7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Mrpl39Q9JKF7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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