Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pdzd9Q9D9M4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pdzd9Q9D9M4 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pdzd9Q9D9M4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pdzd9Q9D9M4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pdzd9Q9D9M4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pdzd9Q9D9M4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pdzd9Q9D9M4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pdzd9Q9D9M4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pdzd9Q9D9M4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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