Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rcbtb2Q99LJ7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rcbtb2Q99LJ7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms