Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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