Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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