Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trim68Q8K243 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trim68Q8K243 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trim68Q8K243 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trim68Q8K243 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trim68Q8K243 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trim68Q8K243 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trim68Q8K243 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trim68Q8K243 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trim68Q8K243 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trim68Q8K243 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Trim68Q8K243 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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