Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pramef8Q8CE24 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pramef8Q8CE24 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms