Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms