Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms