Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms