Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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