Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt40Q6IFX3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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