Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms