Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cxcl2-201ENSMUST00000075433 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms