Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcc1P97496 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms