Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2nP61089 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms