Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Irf5P56477 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Irf5P56477 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Irf5P56477 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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