Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms