Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TtlP38585 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtlP38585 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtlP38585 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtlP38585 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtlP38585 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtlP38585 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtlP38585 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TtlP38585 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms