Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NefhP19246 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms