Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms