Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms