Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20939L7N243 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms