Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
E030018B13RikJ3QMS9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms