Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp946F6VWU8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms