Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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