Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms