Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed5Q9CXE7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms