Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms