Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms