Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SptssbQ925E8 Kdm4a-203ENSMUST00000106403 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms