Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smc1bQ920F6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smc1bQ920F6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smc1bQ920F6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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