Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms