Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cabp4Q8VHC5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cabp4Q8VHC5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cabp4Q8VHC5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cabp4Q8VHC5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cabp4Q8VHC5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cabp4Q8VHC5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cabp4Q8VHC5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cabp4Q8VHC5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cabp4Q8VHC5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms