Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssxb10Q6XAR7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssxb10Q6XAR7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssxb10Q6XAR7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssxb10Q6XAR7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssxb10Q6XAR7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssxb10Q6XAR7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ssxb10Q6XAR7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssxb10Q6XAR7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ssxb10Q6XAR7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ssxb10Q6XAR7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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