Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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BcanQ61361 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms