Protein–RNA interactions for Protein: Q571I4

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q571I4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRAG1Q571I4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRAG1Q571I4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PRAG1Q571I4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PRAG1Q571I4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PRAG1Q571I4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PRAG1Q571I4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PRAG1Q571I4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PRAG1Q571I4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRAG1Q571I4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms