Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms