Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Spatc1Q148B6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Spatc1Q148B6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Spatc1Q148B6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Spatc1Q148B6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Spatc1Q148B6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Spatc1Q148B6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212 ms