Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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