Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms