Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Rab11bP46638 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Rab11bP46638 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Rab11bP46638 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Rab11bP46638 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Rab11bP46638 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rab11bP46638 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rab11bP46638 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab11bP46638 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rab11bP46638 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rab11bP46638 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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