Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms