Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms