Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxb4P10284 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms