Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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