Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Efna3O08545 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms