Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms